癌症术后肠道菌群通常会发生以下变化：
一、多样性降低
手术创伤影响
癌症手术作为一种重大的身体创伤，会引起身体的应激反应。这种应激反应可能会干扰肠道菌群的正常生长和繁殖环境。例如，手术过程中的失血、组织损伤以及术后的疼痛和炎症反应，都可能导致肠道菌群的多样性下降。
像胃肠道手术，由于直接对肠道进行操作，破坏了肠道原有的物理结构和微环境，使得部分细菌难以生存，一些原本在肠道中占比较小的细菌种类可能会因为无法适应新环境而消失。
抗生素使用
术后为了预防感染，患者通常需要使用抗生素。抗生素在杀死有害菌的同时，也会对肠道内的有益菌造成损害。许多有益菌如双歧杆菌、乳酸杆菌等对维持肠道菌群多样性起着关键作用，抗生素的使用会导致这些有益菌数量减少，从而降低肠道菌群的多样性。
例如，广谱抗生素可能会无差别地抑制多种细菌的生长，使得肠道菌群的种类和相对丰度发生改变，一些原本丰富的细菌群落变得单一。
二、有益菌减少、有害菌增多
饮食改变和消化功能受损
癌症术后患者的饮食摄入往往会减少，而且饮食结构也可能发生改变。这会导致肠道菌群的食物来源发生变化，使得一些依赖特定食物成分生存的有益菌缺乏营养而减少。
同时，癌症手术可能会影响消化功能。例如，胃切除术后胃酸分泌减少，小肠切除术后营养吸收面积减小等，这些都会影响肠道的消化和吸收功能。消化功能受损可能会使肠道内的环境变得更有利于有害菌的生长。
比如，在消化功能下降的情况下，未被充分消化的食物残渣可能会在肠道内堆积，一些有害菌如肠杆菌科细菌、艰难梭菌等可能会利用这些物质大量繁殖。
免疫功能变化
癌症手术和疾病本身都会对免疫系统产生影响。术后患者的免疫力可能会下降，使得身体对有害菌的抑制能力减弱。
例如，免疫系统对肠道菌群的监视和调节功能降低，原本受到免疫系统控制的有害菌，如某些条件致病菌，可能会趁机增殖。而且，肠道菌群也会影响免疫系统，菌群失衡可能进一步削弱免疫功能，形成恶性循环。
化疗和放疗的影响（如果有后续治疗）
化疗药物和放疗可能会对肠道黏膜造成损伤，破坏肠道屏障功能。这使得肠道菌群更容易接触到肠道组织，增加了有害菌的侵袭机会。
例如，化疗药物可能会引起肠道黏膜的炎症和坏死，使得肠道内的有害菌如产气荚膜梭菌等能够突破受损的黏膜屏障，进入肠壁组织，引发感染和炎症，同时也会导致有益菌的生存环境进一步恶化。